Équipements
Moyens techniques et infrastructures
Ces moyens, disponibles dans les structures de recherche, ainsi que les plateaux techniques des différentes universités, constituent des soutiens solides aux actions de la SFR et permettent aux chercheurs et enseignants-chercheurs de mener leur recherche dans de bonnes conditions.
A l'université de Tours
U1253 - iBrain
Equipement petit animal :
- Stimulateur magnétique rTMS, tDCS, support CTI rongeur, cellule technique d'imagerie, lecteur microplaque, armoire -86°C isotemp, équipements de chirurgie stéréotaxique, module anesthésie, caméra numérique professionnelle, système implantable, EthoVision et module données externes, fear conditioning.
- Scanners US haute et basse fréquence (de 2.5MHz à 70MHz); Systèmes d’imagerie TEP/CT dédiés au petit animal et au primate non humain ; Système de neuronavigation ; Electromyographe (x2 EMG); Controleur de vibrations externs; Plateforme d’imagerie optique: ; Plateforme de Patch-clamp; Salles de culture cellulaire (L2) ; Differents bancs de mesures acoustiques
Recherche chez l’homme:
- 2 salles de culture cellulaire (cultures primaires/ iPSC ; lignées cellulaires) ; Themrocycleurs 96 puits ; Microscope inversé à fluorescence Evos M5000 ; Covaris ; Biorad Chemidoc Touch
- Laboratoire d’anatomie et de dissections, scanner laser 3D, accès à des spécimens anatomiques humains post-mortem
- Laboratoire d’explorations neurophysiologiques et comportementales :
- Mesures neurophysiologiques : 3 Systèmes fixes 64 à 128 channels (Biosemi®, Compumedics®, BrainProduct® ActiAmp) 1 système ambulatoire 64 channels (BrainProduct® LiveAmp). Systeme de stimulation Vibrotactile (Dancer Design®Tactor)
- Mesures végétatives périphériques : Biopac MP36®, 10 brassières Equivital, Phymep®
- Mesures oculométriques et pupillométriques : Systèmes fixes Eye-Link®,ASL®, 2 SMI RED500®, et ambulatoires 3 Tobii pro Fusion®, Lunettes SMI ETG®
- Mesures neuropsychologiques et comportementales : Logiciel FaceReader6®, Ambulatoire : 10 iPod équipés du logiciel Psymate®,2 montres Empatica®.
- Accès aux équipements d’imagerie chez l’homme sur site CHU de Tours: IRM 1.5 and 3T, CT Scanner.
PST Analyse des Systèmes Biologiques
Cette plateforme offre les ressources humaines et technologiques dédiées à des projets de recherche dans le domaine biomédical et l’analyse chimique. Elle est subdivisée en 5 départements : chimie analytique et métabolomique, Génomique, Microscopie, Cytométrie en flux, Imagerie petit animal. qui proposent des outils performants pour chacune de ces approches Voir le site : https://pst-asb.med.univ-tours.fr/ pour le détails des outils.
A l’Inrae, Nouzilly
Plateforme PIXANIM
La plate-forme PIXANIM offre différents moyens d’investigation in vivo, favorisant les approches non-invasives pour des études dynamiques, et/ou ex vivo, allant de l'animal entier jusqu'à la molécule en passant par toutes les échelles intermédiaires (organes, tissus, cellules pro- et eucaryotes, fluides). PIXANIM propose un ensemble d'outils et développe des stratégies analytiques permettant l'acquisition de mesures phénotypiques à haut débit, multi-échelles et multi-modales. Ainsi, différentes technologies d’imagerie in/ex vivo (Imagerie par Résonance Magnétique (3T), tomodensitométrie CT-Scan, endomicroscopie laser par fluorescence, échographie 3D doppler, imagerie moléculaire par spectrométrie de masse MALDI-TOF) peuvent être appliquées et combinées entre elles ou avec des outils d’analyses moléculaires (spectrométrie de masse haute résolution Orbitrap) en protéomique (peptides, protéines) et lipidomique (lipides). La plateforme est labellisée IBiSA et certifiée ISO9001-2015.https://www6.val-de-loire.inrae.fr/pixanim
Analyse du comportement
Les équipes de la PRC disposent de différents outils : logiciel de tracking video NoldusEthovision XT permettant de visualiser 16 animaux à la fois ; logiciel d’observations comportementales, Observer, Noldus.Un plateau nouveau technique multi-espèces (rongeurs, petits ruminants, oiseaux domestiques) réunissant des dispositifs de tests, des logiciels de d’observation et de suivi, dédiés à l’étude de comportement animal, sera mis en place au sein de la PRC à compter de 2023.
A l’Université de Poitiers
Culture cellulaire, tri cellulaire matériel Miltenyi, Imageur protéomique Gbox, Plateforme ImageUP : https://sfa.univ-poitiers.fr/imageup
Plateforme de Recherche en expérimentation animale en Biologie-Santé
permettant de réaliser :
- de l’élevage de souris transgéniques, des études en neurobiologie sur animaux vieillissants, des expérimentations en confinement A2, de la chirurgie sur rongeurs, de l’imagerie sur animaux vivants.
- Les expériences de comportement chez les rongeurs: The staircase test (Phymep), The GaitLab system (ViewPoint), The Rota-Count-8 (Columbus Instruments; Phymep), Rota-rod Counter 3253 (Imetronic), Locomotor activity chambers (Imetronic), Motor activity wheels (Imetronic), Operant Chambers (Imetronic, Coulbourn, MedAssociates), Videotrack systems (ViewPoint),Conditioned Place Preference cages (Imetronic).
LNEC :
Cages opérantes (52), Système enregistrement électrophysiologique chez l’animal (anesthésié, patch-clamp et freely moving), Système de privation de sommeil, EEG (télémétrie), Cadres stéréotaxiques, Système d’enregistrement de photométrie par fibre optique, pléthysmograhe, Système d’analyse d’image (stéréologie, cartographie histologique), Phenoworld, Live Mouse Tracker, Gaitlab, Open field, Elevated plus maze., Micro-injecteur motorisé, Appareil de lésion traumatique par impact, Simi-motion
Plateforme du CeRCA :
De nombreux équipements en propre ou sont mis à disposition par la MSHS de Poitiers. En particulier, 6 oculomètres (Eyelink, Tobii), un système de mesure des paramètres physiologiques (fréquence cardiaque, électromyographie, réponse électrodermale, etc.), des capteurs de mouvement optique et électromagnétique, 4 systèmes de mesure des activations cérébrales (2 systèmes EEG et 2 systèmes NIRS), 2 systèmes de réalité virtuelle, des systèmes de mesure de l’activité langagière (tablettes graphiques, chaine d’analyse de la parole) et un système numérique de montage de vidéos professionnelles.
A l’Université d’Orléans
CBM :
- Cytometrie et imagerie cellulaire (P@CYFIC): Equipements en cytométrie en flux, video-microscopes, microscope laser confocal.
- Spectrometrie de masse et proteomique: MALDI-TOF/TOF et ESI-IT-ETD instruments, UltraHPLC et high-resolution ESI-QTOF CID et ETD instruments.
- Spectroscopie RMN : Spectromètres 600 MHz, 400 et 700 MHz (équipé de cryo-sonde).
- Spectroscopie optique: Spectromètres d’absorption UV-Vis-NIR, fluorimètres, de dichroïsme circulaire et de fluorescence et bioluminescence.
- Microscopie à Force Atomique (AFM), Spectrometrie Raman, microscopie optique.
- IRM préclinique Spectromètres imageur Bruker Pharmascan 7T et Biospec 9.4T.
- Incubateurs à bactéries et levure, à CO2 pour cellules eucaryotes
- Imageur chemiluminescence Syngene
- Dissecteur de levure Singer.
Laboratoires équipés pour la chimie de synthèse et la caractérisation complète d’agents de contraste IRM potentiels :
- Stations d’hypoxie pour culture cellulaire en conditions contrôlées en oxygène
- Appareils pour le tri cellulaire (AutoMacs) et comptage (Nucleocounter)
- Appareils pour la biologie moléculaire : PCR, RTqPCR (Light Cycler Roche), Droplet PCR (Biorad), Agilent
- Lecteurs microplaques (Enspire, Mithras) pour techniques biophysiques : BRET, TR-FRET
- Appareil d’électrophorèse Biorad, Transblot pour les analyses biochimiques
- Cryostat, microtome pour la réalisation de coupes histologiques
- Etudes in vivo : appareil d’anesthésie, Von Frey eléctronique, appareil de stéroéotaxie
- Systèmes d’anesthésie.
ICOA :
Matériel nécessaire à la synthèse, la purification (Combi-Flash) et l’analyse (Masse, RMN, LC-MS, IR) des composés synthétisés.
- 3 spectromètres de masse triple quad sources ESI, APCI, APPI
- Méthodes séparatives HPLC, nano-LC, UPLC, SFC, GC, EC, HPTLC, CPC
- Détecteurs à Diffusion de Lumière (DEDL)
- Clusters de calcul scientifique CPU PowerEdge R710 et clusters cartes GPU K80 et TitanZ)
Laboratoire Physiologie Ecologie Environnement :
- 5 postes d’électrophysiologie (2 patch clamp, 2 double microélectrode dont un poste robotisé, 1 poste de mannitol-gap), 1 poste d’imagerie calcique.
Laboratoire INEM :
Plateforme de comportement pour rongeurs (Morris water maze, Ymaze, Elevated plus maze, Radial arm maze, openfield, chamber sociability test, Rotarod, Ultravox…) et systèmes videotracking avec logiciels associés (Ethovision, The Observer, Ultravox softwar. Histologie, microtome, cryomicrotome, vibratome.
Pletysmographe, FACS, Luminex-Multiplex, Microscope à fluorescences, microscopie, plateforme d’histologie (cryostat, microtome, scanner de lame, automate d’inclusion …), Plateforme western-blot, RT-qPCR, Dissociation cellulaire (Miltenyi), salles de cultures cellulaires.
A l’Université de Nantes et d’Angers
Laboratoire de Psychologie des Pays de Loire LPPL :
- Plateforme ALLEGRO (depuis novembre 2018) : Angers Living Lab En GéRiatriehOspitalière (ALLEGRO). Il s’agit du premier Living Lab gériatrique hospitalier de France. Cet incubateur d’innovations, doté d’une chambre d’hospitalisation expérimentale et connectée, est installé au CHU d’Angers dans le service de Gériatrie (Reponsable Cédric Annweiler) et vise à améliorer les soins hospitaliers gériatriques et transposer ces gérontechnologies au domicile des personnes âgées pour favoriser le « bien vieillir ».
- Plateforme angevine d’analyse des comportements en LLSH : Ce UserLab a ouvert en janvier 2021, financé par le CPER 2015-2020, le RFI OIC et l’UA (outils de captation et de diffusion immersifs et non immersifs, packs de diffusion d'odeurs, d'analyse des expressions faciales et de mesures éléctro-physiologiques, eyetracker etc.).
- Equipements des deux salles d’expérimentation site de Nantes :
- 5 appareils permettant le recueil de mesures physiologiques variées : NeXus-10 MKII
- 2 Casques de réalité virtuelle (RV) HTC Vive pro kit complet
- 2 trépieds pour dispositif RV (capteurs)
- 4 Lunettes eye tracking:
- 2 eye trackers Pupillab
- 1 HTC Vive Binocular Add-on (HTC Vive eye tracking add-on with 2 x 200Hz eye cameras)
- 1 Pupil CorePupil Core eye tracking headset